一直觊觎桔梗的强盗鬼蜘蛛将灵魂出卖给了妖怪让妖怪吞噬自己，后来死去得鬼蜘蛛变成了邪恶的妖怪奈落，奈落分别变成两人的样子，打伤桔梗抢走了四魂之玉，袭击犬夜叉。
犬夜叉误以为桔梗欺骗他，愤怒的袭击村子，夺走了四魂之玉。
而桔梗用尽最后的力量，射出封印的箭，将犬夜叉封印在了御神木上。
犬夜叉带着绝望和怨恨陷入了五十年的沉睡，桔梗也追随他带着玉而死。
犬夜叉被封印五十年后，桔梗五百年之后的转世——日暮戈薇，一个普通的神社少女，穿越了时空，解除了他的封印，并重新将四魂之玉带回了战国时代。
鬼蜘蛛曾被大火烧伤，摔下悬崖，被桔梗救下。
贪恋桔梗的鬼蜘蛛为了得到可以活动的身体，让妖怪吃掉了自己残废的身体，并因此诞生出了妖怪奈落。
在旅途中戈薇与犬夜叉一行人先后结识了法师弥勒，并通过弥勒处得知五十年前造成他和桔梗相互误解的人就是奈落。
在旅途中，两人结识了失去父亲的小狐妖七宝。
七宝为了向雷兽兄弟飞天满天报杀父之仇，前来偷取戈薇的四魂碎片。
戈薇为了救七宝，结果被满天抓走，犬夜叉和七宝找到了雷兽兄弟，经过了一番苦战，犬夜叉终于战胜了雷兽兄弟，救回了戈薇。
小狐狸妖怪七宝也加入了戈薇和犬夜叉的队伍，一起踏上了寻玉的旅途。
杀生丸找到犬夜叉后的杀生丸利用妖怪无女假扮犬夜叉过世的母亲十六夜接近犬夜叉。
在逃出墓地所在后杀生丸起了杀心，想杀害犬夜叉，但无女因为母爱散发为了保护犬夜叉而死。
在犬夜叉得到铁碎牙后，杀生丸妖化成犬型，然而铁碎牙感知到犬夜叉保护人类的决心，妖化了的铁碎牙斩断了杀生丸的左臂。
杀生丸后来更是三番两次的试图夺取铁碎牙。
弥勒就是想通过收集四魂之玉来找出奈落并杀了他。
犬夜叉也从弥勒处得知五十年前造成他和桔梗相互误解的人就是奈落，于是加入了弥勒法师的戈薇一行开始了寻找四魂碎片以及奈落的征程。
就在这个时候奈落找到杀生丸，［你好像很烦恼啊，公子，您就是犬夜叉的哥哥杀生丸少爷吗？］
［你是什么人？］，［我是和您一样憎恨犬夜叉的人］
你可以试一试这个手臂，就可以拿起犬夜叉所拥有的妖刀碎牙了，这个巢一定对你有所帮助。
［报上你的名号来吧］
［我叫奈落！］
这边犬夜叉，日暮戈薇等人正在村庄里吃饭休息。就在这时杀生丸发起了攻击。”
［你的动作还是那么迟钝啊，犬夜叉。］
［混账，杀生丸，你来干什么？］
［我来要你腰间的铁碎牙。］
说着杀生丸面向犬夜叉袭来，把犬夜叉的铁碎牙打飞，并握住了铁碎牙。
［为为什么你能拿起铁碎牙］
［你明白这把刀让区区半妖使用有多浪费吧。］
就在这时，弥勒立刻使用风穴，杀生丸立即使用巢，最猛胜牺牲自身的毒封住弥勒的风穴。
犬夜叉挡住杀生丸的攻击，让弥勒戈薇赶快走！并趁机拿走自己的刀。杀生丸看了看便走开走开了。
日暮戈薇赶忙查看犬夜叉的伤势，很快犬夜叉的伤就好，犬夜叉就让戈薇先回到现代。
戈薇和犬夜叉告别后，便从尸骨之井回到现代了。
弥勒和犬夜叉去找枫婆婆了，枫婆婆说到犬夜叉看你的伤势暂时不能够参加战斗了。
就在经过除妖村的时候，犬夜叉与一位除妖少女发生了战斗。
奈落设下诡计让珊瑚的弟弟琥珀被奈落控制并射杀了父亲和姐姐。奈落使计让珊瑚听到村里人被犬夜叉
四魂之玉篇 第1章奈落与杀生丸联手出击
